В. А. Букин, А. П. Сарвазян, Д. П. Харакоз
(Институт биофизики АН СССР, Пущине)
Вода — основной молекулярный компонент биологических систем. Водное окружение определяет структуру и функционирование биополимеров. Уменьшение количества воды в биологических системах ниже какого-то предела приводит к остановке биологических процессов. Поэтому взаимодействие биологических соединений с водой — гидратация — уже давно является предметом широких исследований [138—140].
Различными физическими методами выявлены разные типы взаимодействия воды с биополимерами. Прямые структурные методы—нейтронное рассеяние и рентгеноструктурный анализ— показали, что в кристаллах ДНК и белков некоторое количество воды жестко связано с биополимером. Например, методом рентгеноструктурного анализа рубредоксина с разрешением 0,12 нм было обнаружено 127 молекул воды, локализованных на его поверхности [141]. На порядок большие количества воды, взаимодействующей с биополимерами, определяются с помощью диэлькометрии, измерения изотерм адсорбции, гидродинамических методов, с помощью измерения незамерзающей воды методами ЯМР и калориметрии [138].
Различия в физической природе исследованных характеристик воды, взаимодействующей с биологическими молекулами, делают затруднительным, а иногда и невозможным, сравнительный анализ результатов, полученных разными методами и в разных условиях, поскольку не всегда ясно, одну ли и ту же воду регистрируют разные методы.
Молекулы аминокислот, белков, нуклеиновых кислот и других биологических соединений составлены из атомных группировок, резко различающихся по характеру взаимодействия с молекулами воды в растворе: они содержат полярные группы, образующие водородные связи с водой; заряженные группы, вызывающие сильное электрострикдионное сжатие воды в своей гидратной оболочке; гидрофобные группы, влияние которых на многие характеристики воды качественно отличается от влияния полярных и заряженных групп. Поэтому гид — ратная оболочка биополимеров гетерогенна и такой получивший широкое распространение интегральный параметр, как «число гидратации», явно недостаточен. Для описания гидратации необходимы количественные данные об изменениях физических характеристик гидратной воды и о размерах области вокруг отдельных атомных групп молекулы, охваченной этими изменениями.
Здесь будут рассмотрены результаты исследования гидратации биологических молекул в разбавленных водных растворах, т. е. в условиях, в которых отсутствует взаимодействие между молекулами растворенного вещества. Обсуждение экспериментального материала будет сосредоточено на следующих основных вопросах.
1. На каких расстояниях проявляется влияние молекул растворенного вещества и их отдельных атомных групп на физические свойства воды?
2. Каковы свойства воды около заряженных, полярных и гидрофобных атомных групп биологических соединений и чем они отличаются от свойств чистой воды?
3. Существуют ли принципиальные различия в гидратации биополимеров и гидратации отдельных низкомолекулярных соединений, из которых они состоят?
При обсуждении экспериментальных данных, обосновывающих ту или иную закономерность, мы в первую очередь будем опираться на результаты, полученные акустическим [142] и денситометрическим методами, поскольку, с одной стороны, именно эти методы дали наибольшее количество экспериментального материала, а с другой — эти методы наиболее близки авторам по роду их занятий.